داستان قسمت دوم فیلم روز استقلال ، 20 سال پس از وقایع قسمت اول اتفاق می‌ افتد. انسان‌ ها پس از شکست دادن بیگانگان در قسمت اول ، از تکنولوژی‌ های آنها استفاده کردند تا به پیشرفت‌ های تکنولوژیکِ چشمگیری دست پیدا کنند و این مساله باعث خشم بیگانگان شده است و آنها برای باز پس گرفتن تکنولوژی‌ های خود دوباره به زمین حمله می کنند و...

زمانی که یک میلیونر به نام "جیمز کینگ" متهم شناخته می شود و باید به مدت ده سال در زندان بماند، وی از شخصی به نام "دارنل لوئیس" می خواهد به او آموزش های سفت و سختی دهد تا پشت میله های زندان بتواند از خود دفاع کند...

در قرن هفدهم، دوره‌ای وجود داشت که به دوره‌ی محاکمه و کشتن جادوگران معروف بود، این محاکمات در شهر "سِیلم"، "ماساچوست" اتفاق می‌افتاد، نام مستعار این شهر، شهر جادوگران است. حالا این اتفاقات واقعی، دستمایه‌ی موضوع این سریال شده است. در این سریال، طبق خلاصه هایی که از آن وجود دارد، آورده شده که قرار است رازهای تاریک و ماوراءالطبیعه‌ای که باعث انجام این محاکمات شده است را ببینیم.